Aufgrund mehrerer technischer Zwänge wurde beschlossen, dass die Eisenbahnstrecke durch das Stadtzentrum von Tonnerre verlaufen sollte. Im Jahr 1849 wurde die kaiserliche Eisenbahnlinie Paris-Tonnerre eingeweiht - mit Tonnerre als Endstation! Und davon profitiert die Stadt sehr. Zwei Jahre später, anlässlich der Eröffnung des Abschnitts Tonnerre-Dijon, beehrte Louis-Napoléon Bonaparte die Stadt sogar mit seinem Besuch. Seit seiner Errichtung wurde der Bahnhof von Tonnerre als "außergewöhnlicher Bahnhof" bezeichnet, die höchste architektonische Auszeichnung für Eisenbahnbauwerke.